到目前为止，我国发现并正式命名的翼龙有7属7种，甘肃境内发现了2属2种，即庆阳环河翼龙和玉门湖翼龙，接近于全国发现的30%。由此来看，甘肃是这种会飞的爬行动物的主要生活区域之一。

　　白垩纪轰动世界的玉门鸟

　　甘肃白垩纪最重要事件，是在玉门昌马公社沈家湾村西北的下沟组中部灰黑色泥岩中，采获到一件罕见的早期鸟类左后下肢骨骼化石，带全部趾骨和爪，呈自然状态连在一起，时代为早白垩世，发掘出我国少有的中生代鸟类骨骼化石、大而完整的鳄鱼化石和只有羊羔大小的恐龙化石。这标志着鸟类祖先最早生活在我国。

　　这个标本一经公布，就引起世界学术界的的极大关注，人们的注意力已从海相沉积的始祖鸟转向陆相沉积鸟类，希望的目光也逐渐投向中国。打破了100多年来侏罗纪仅有德国鸟的记录。

　　此次发掘出的中生代鸟类化石，年代久远长达上亿年，但纹路仍清晰可见，保存十分完好。自1861年德国发现首块始祖鸟化石后，鸟类的起源成了生物学界最感兴趣的课题之一，学术界为此争论不休，一个很重要的原因是中生代鸟类化石发现极少。1984年，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所侯连海教授在甘肃玉门发掘出了“甘肃玉门鸟”，此次发掘出的鸟骨化石印证了“甘肃玉门鸟”是我国第一件中生代鸟类化石的学术论断。这一发现对于玉门被称为“古生物化石的故乡”提供了新的证据，同时，也为生物学界研究鸟类的起源提供了新的佐证。

　　新生代：獏鼠和甘肃孲兽

　　在始新世时，甘肃古生物化石比较稀少，仅在玉门附近找到被子植物花粉。距今4000万年的新生代，甘肃古大陆上生物再次开始活跃了，哺乳动物的种类增多，植物化石也常与古动物共生。最早发现化石在玉门市以北的骟马城附近，有两种动物獏鼠和甘肃孲兽。孲兽目前所知是亚洲特产的化石动物。另在玉门新民堡发现一种龟化石取名为嘉峪关甘肃龟。

　　玉门硅化木地质公园

　　目前，全省已获批准建立地质公园22处，其中国家级6处，省级16处。在甘肃地质博物馆的地质遗迹和地质公园介绍中，玉门硅化木地质公园被隆重推出作了介绍。2005年9月省国土厅建立省级地质公园位于玉门市东南约40公里，面积37平方公里，主体地质遗迹为集中连片分布的硅化木。园区产有丰富的中生代化石，其中又以硅化木、鱼类、昆虫、双壳类、腹足类、介形虫和叶肢介尤为丰富，具有重要的古生物研究价值。硅化木属古松柏类，质地坚硬，年轮清晰可辨，具有较高的观赏价值。